《プリフェクトの箱庭》 佐倉澪斗因為某些緣故而轉入住宿制的貴族學校。雖然受到周遭同學們的霸凌，或是被恥笑為「暴發戶」，他依然用雜草般的韌性忍耐過去。有天晚上，睡不著的他誤入了一間禮拜堂。在那裡，他認識了神秘又俊美的學長——東院月人。以此為契機，受到眾人憧憬的月人竟指定澪斗當「指導生」…!?在擁有獨自規范及階級制的學校裡，一段戲劇化的戀情就此展開…！