故事的舞臺是面向日本海的綾凪市，該城市是從10年前發生的“同時多發無力氣癥”災害中復興起來的未來型新興城市。17歲的高中生的神鄉慎與14歲的弟弟洵和28歲身為綾凪市警察署長的諒在分隔10年后相遇了。就在那個時候，一系列的怪異事件再度侵襲綾凪市，“persona”再度覺醒！三兄弟命運的齒輪開始轉動…