《月下斬魔之花》講述的是被命運玩弄于股掌之間的少女犬上朔夜的悲情故事。以斬殺獸化的狗神附體之人為使命的犬上朔夜活在痛苦中。她初次愛上的少年——甲斐名也成為了一個狗神附體的犬人，并墮落為了一個殘酷的殺戮者。最終在大混亂之后，眾犬神的頭領——名為紅頭巾的少女從囚牢的地下拯救了被囚禁的眾多犬神，她要復活大犬神——她的姐姐，建立一個任由犬神橫行的犬神之國。而犬上朔夜擊敗了甲斐名，下意識地放過了他，而甲斐名則失去了記憶，成為了只效忠紅頭巾的守護者。愛與殺的對決，一次有一次重復地在月夜下上演。