2025年4月，在一個名為沖繩的島嶼上。這個本來看似十分和平的島嶼，但是已經在若干年前宣告上的獨立，伴隨而來就是與國際間多重的摩擦。就在這時深井青和青梅竹馬阿拉塔·娜露在這些環境下，經歷了珊瑚巖的爆炸以及葛吉爾以及他的伙伴和Triton（藍色世代）等眾人的幫助，青登上了尼爾瓦修修（Mark 1）的IFO。等待著他的是保護世界、島嶼與家園的任務、充滿迷團的敵人Secrets和隨之相關的珊瑚巖的任務，以及一段不為所知的過去…