「監獄學園」講述了東京郊外的私立八光學園的故事，這所為了培養大小姐的貴族學校從公元2011年4月開始正式改為了男女合校，首批入學的男子有五個人。他們并不是全員都帥得一塌糊涂能夠迷倒眾生，甚至相貌屬于很不起眼的類型。在身處周圍1000位女生的女校范圍內，這些男人能夠克制住自己蓬勃的青春欲望嗎？主人公藤藤野清志等人的命運究竟如何呢？